Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms