Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atl2Q6PA06 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms