Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp49Q6P9L4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms