Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc148Q6P5U8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms