Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C5

Smug1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smug1Q6P5C5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smug1Q6P5C5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smug1Q6P5C5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms