Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam222bQ6P539 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam222bQ6P539 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam222bQ6P539 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam222bQ6P539 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam222bQ6P539 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam222bQ6P539 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam222bQ6P539 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam222bQ6P539 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms