Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms