Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms