Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SphkapQ6NSW3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SphkapQ6NSW3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms