Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Best3Q6H1V1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms