Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KdsrQ6GV12 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KdsrQ6GV12 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KdsrQ6GV12 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms