Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nckap5lQ6GQX2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nckap5lQ6GQX2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nckap5lQ6GQX2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms