Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Edrf1Q6GQV7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms