Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swap70Q6A028 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swap70Q6A028 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms