Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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