Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms