Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms