Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctnna3Q65CL1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms