Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Surf4Q64310 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms