Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt12Q64291 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt12Q64291 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms