Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zfp248Q640N4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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