Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc18Q640L5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccdc18Q640L5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
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