Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vil1Q62468 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms