Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vat1Q62465 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms