Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnga2Q62398 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga2Q62398 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga2Q62398 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms