Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TrhQ62361 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TrhQ62361 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TrhQ62361 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TrhQ62361 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrhQ62361 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrhQ62361 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TrhQ62361 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms