Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms