Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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