Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4bQ62179 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms