Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm38Q62176 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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