Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phox2aQ62066 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms