Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Npm1Q61937 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm1Q61937 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Npm1Q61937 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm1Q61937 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm1Q61937 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm1Q61937 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm1Q61937 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm1Q61937 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm1Q61937 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms