Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd47Q61735 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd47Q61735 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms