Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms