Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ecm1Q61508 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms