Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd53Q61451 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd53Q61451 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms