Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pde3bQ61409 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde3bQ61409 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms