Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AcanQ61282 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AcanQ61282 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AcanQ61282 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AcanQ61282 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AcanQ61282 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms