Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc9a1Q61165 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a1Q61165 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a1Q61165 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a1Q61165 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a1Q61165 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a1Q61165 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a1Q61165 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms