Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc6Q61143 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms