Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamb3Q61087 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamb3Q61087 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms