Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms