Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfrsf8Q60846 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms