Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf4Q60793 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms