Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms