Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stxbp3Q60770 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stxbp3Q60770 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms