Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgaeQ60677 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms