Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr2f1Q60632 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nr2f1Q60632 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms