Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf123Q5XPI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms