Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Setd5Q5XJV7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Setd5Q5XJV7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Setd5Q5XJV7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Setd5Q5XJV7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms